- Người chơi sẽ vào vai NieR, một chàng trai trẻ sống cùng người em gái bị bệnh nan y tên là Yonah tại một thành phố bị bỏ hoang hậu tận thế. Khi bệnh tình ngày càng trầm trọng, nhân vật chính phải lên đường tìm kiếm phương pháp chữa trị trước khi quá muộn. Anh gặp nhiều nhân vật khác trên đường: từ Weiss, một cuốn sách biết nói đến một phụ nữ kiếm sĩ tên Kaine... và cuối cùng là một cậu bé tên Emil với đôi mắt có thể hóa đá bất cứ thứ gì cậu ta nhìn vào. Ngôi làng sau đó bị tấn công bởi một Shadow khổng lồ tên Shadowlord, kẻ đã bắt cóc Yonah - và cả nhóm phải đuổi theo nó trên khắp thế giới để lấy lại cô.
- Nier Replicant là một trò chơi hành động phiêu lưu có chủ đề tối tăm và u ám hơn các tựa game cùng thể loại như Legend of Zelda. Nier tuân theo nhiều tiêu chuẩn của thể loại game này nhưng đôi khi cũng đi ngược lại sự mong đợi của người chơi. Xuyên suốt hành trình trải nghiệm, Nier khiến cho người chơi phải suy ngẫm về các vấn đề như bạo lực, sự ác độc của chính con người và ý nghĩa của việc tồn tại trong một thế giới luôn muốn chúng ta chết và chính thế giới cũng đang chết dần mòn.
- Trong lúc chơi game, Nier sẽ thỉnh thoảng bỗng dưng đổi phong cách. Có những lúc chúng ta sẽ chơi như một tựa game bullet hell, nhưng cũng có lúc camera quay từ trên xuống khiến chúng ta cảm thấy như đang chơi Diablo vậy.